Naruto berättelse ritning
Jag vet inte om det någonsin förklarades, men hur lärde sig Nagato om hur man skapar smärtvägar?
Obito var ansvarig för skapandet av Akatsuki i sitt nuvarande tillstånd. han manipulerade Nagato och de omkring sig och formade de idéer och ideal han behövde i Nagatos huvud. Efter att Yahiko, Nagatos vän och första ledare för Akatsuki dog, gav Nagato efter för Obitos frestelse och det är rimligt att anta att Madara förklarade hur Rinnegan arbetar för Obito för att hjälpa honom att återuppliva Madara bättre.
1- 3 IIRC, uttalandet Obito var ansvarig för skapandet av Akatsuki är inkorrekt. naruto.wikia.com/wiki/Akatsuki - Föräldralösa barn under andra världskriget i Shinobi, de tre skapade Akatsuki som ett sätt att skapa fred i sitt hemland